Programas 

SANIDAD 

Prevenir, diagnosticar, controlar y erradicar enfermedades y plagas de las especies acuáticas vivas, con la finalidad de proteger su salud y la del hombre.

INOCUIDAD ACUICOLA Y PESQUERA 

Mantener y mejorar el patrimonio fitozoosanitario y de inocuidad agroalimentaria, acuícola y pesquera en los 60 municipios del estado de Tlaxcala.

VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA 

Establecer las acciones de Vigilancia Epidemiológica con la finalidad de llevar a cabo la detección de plagas y enfermedades emergentes o reemergentes de manera oportuna y en su caso, implementar acciones de manejo o bien la supresión, control o erradicación de estas.